Binary Domain é um shooter baseado no esquadrão original de Toshihiro Nagoshi, criador de algumas das mais populares franquias SEGA. Neste game, os jogadores estão no meio de uma batalha para salvar a humanidade de robôs que invadem uma Tóquio futurista, em 2080. Lutando nos locais mais abandonados da cidade, os jogadores controlam uma equipe de equilíbrio da paz internacional, que logo começa a questionar seu entorno e as escolhas que fazem. Os robôs se tornam mais humanos ou os seres humanos são cada vez mais máquinas?